Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms