Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
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