Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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