Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sox19Q62249 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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