Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gli3Q61602 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli3Q61602 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli3Q61602 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli3Q61602 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli3Q61602 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli3Q61602 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli3Q61602 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli3Q61602 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli3Q61602 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli3Q61602 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli3Q61602 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms