Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms