Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms