Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms