Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms