Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pid1Q3UBG2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms