Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Kdm4dQ3U2K5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Kdm4dQ3U2K5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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