Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21440Q3TTD8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21440Q3TTD8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21440Q3TTD8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21440Q3TTD8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21440Q3TTD8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21440Q3TTD8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21440Q3TTD8 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21440Q3TTD8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21440Q3TTD8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms