Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rpusd2Q149F1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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