Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms