Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms