Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms