Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nfe2Q07279 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms