Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Itga4Q00651 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms