Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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