Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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