Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms