Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CdaP56389 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CdaP56389 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CdaP56389 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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CdaP56389 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CdaP56389 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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CdaP56389 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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CdaP56389 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CdaP56389 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CdaP56389 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CdaP56389 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CdaP56389 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CdaP56389 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CdaP56389 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CdaP56389 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CdaP56389 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CdaP56389 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CdaP56389 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CdaP56389 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CdaP56389 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CdaP56389 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CdaP56389 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CdaP56389 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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CdaP56389 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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CdaP56389 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CdaP56389 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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