Protein–RNA interactions for Protein: P54116

Stom, Erythrocyte band 7 integral membrane protein, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StomP54116 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
StomP54116 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
StomP54116 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
StomP54116 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms