Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms