Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms