Protein–RNA interactions for Protein: P31315

Gsx1, GS homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx1P31315 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms