Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Xrcc5P27641 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Xrcc5P27641 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Xrcc5P27641 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Xrcc5P27641 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Xrcc5P27641 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Xrcc5P27641 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Xrcc5P27641 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Xrcc5P27641 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Xrcc5P27641 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Xrcc5P27641 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Xrcc5P27641 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Xrcc5P27641 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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