Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkchP23298 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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