Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NefhP19246 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NefhP19246 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NefhP19246 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NefhP19246 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NefhP19246 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NefhP19246 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NefhP19246 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NefhP19246 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NefhP19246 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NefhP19246 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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