Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18532 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18532 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18532 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18532 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18532 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18532 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18532 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18532 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18532 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18532 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18532 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18532 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18532 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18532 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18532 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18532 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18532 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18532 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms