Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Itga5P11688 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms