Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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