Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms