Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cops6O88545 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cops6O88545 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cops6O88545 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cops6O88545 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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