Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp35M0QWN7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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