Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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