Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Lyrm7-205ENSMUST00000144164 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Glul-201ENSMUST00000086199 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm20587-201ENSMUST00000186367 1186 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm44889-201ENSMUST00000207674 1019 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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