Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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