Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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