Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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