Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rarres1F6ZIS7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms