Protein–RNA interactions for Protein: F6ZED4

Gm9970, Predicted gene 9970, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9970F6ZED4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms