Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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PtprbB2RU80 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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PtprbB2RU80 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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PtprbB2RU80 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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PtprbB2RU80 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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PtprbB2RU80 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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