Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113 ms