Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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PtprfA2A8L5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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PtprfA2A8L5 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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PtprfA2A8L5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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PtprfA2A8L5 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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PtprfA2A8L5 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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PtprfA2A8L5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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PtprfA2A8L5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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PtprfA2A8L5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
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PtprfA2A8L5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprfA2A8L5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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