Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Hdac6Q9Z2V5 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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