Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms