Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb3Q9R1P1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms