Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms