Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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